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北京大學(xué)陳興/戴鵬團隊報道唾液酸化糖質(zhì)親和標記新策略

來源:北京大學(xué)      2025-02-12
導(dǎo)讀:北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院、北大合成與功能生物分子中心、北大-清華生命聯(lián)合中心陳興/戴鵬團隊于2025年2月7日在Nature Communications期刊上在線發(fā)表了題為Mutant glycosidases for labeling sialoglycans with high specificity and affinity的研究論文。該工作報道了一類基于糖基水解酶突變策略的唾液酸化糖質(zhì)親和標記工具 GRABs(Glycan recombinant affinity binders)。
親和標記(Affinity labeling)蛋白是生命科學(xué)領(lǐng)域中的重要檢測和分析工具。例如,針對蛋白的高親和力單克隆抗體可在不同實驗場景下實現(xiàn)蛋白質(zhì)的精準靈敏檢測。糖質(zhì)(Glycans),作為一類重要的生物大分子,承載了豐富的生命信息1。對糖質(zhì)進行有效的親和標記是在不同生物學(xué)系統(tǒng)中探索糖質(zhì)功能的重要技術(shù)前提。然而,由于糖質(zhì)的免疫原性較低,針對聚糖的高親和力抗體十分稀少2。凝集素作為一類天然存在的糖質(zhì)結(jié)合蛋白,雖已被廣泛用于糖質(zhì)親和標記,但其底物特異性較低,限制了其在糖質(zhì)功能研究中的應(yīng)用前景3。唾液酸(Sialic acids)是一類帶有負電的九碳糖。作為封端糖,唾液酸常以不同的鍵連形式(如α2,3、α2,6或α2,8)連接在糖鏈末端,在細胞遷移、病原體感染和腫瘤免疫調(diào)節(jié)等生物學(xué)過程中具有重要功能4,5。然而,對唾液酸化糖質(zhì)進行連接方式特異的精準親和標記仍十分困難。

為了解決上述問題,北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院、北大合成與功能生物分子中心、北大-清華生命聯(lián)合中心陳興/戴鵬團隊于2025年2月7日在Nature Communications期刊上在線發(fā)表了題為Mutant glycosidases for labeling sialoglycans with high specificity and affinity的研究論文。該工作報道了一類基于糖基水解酶突變策略的唾液酸化糖質(zhì)親和標記工具 GRABs(Glycan recombinant affinity binders)。
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作者利用了唾液酸酶這類自然界中經(jīng)過長時間進化出的能夠高效識別唾液酸化糖質(zhì)的蛋白質(zhì),從肺炎鏈球菌唾液酸酶(SpNanA)和瘤胃球菌唾液酸酶(RgNanH)催化結(jié)構(gòu)域出發(fā),在其保守的催化機理基礎(chǔ)上,采用理性設(shè)計的方式進行小規(guī)模突變篩選,分別獲得了識別各種連接方式和特異性識別α2,3連接唾液酸結(jié)合蛋白,并命名為GRAB-Sia和GRAB-Sia3。與目前唾液酸親和標記使用的、具有顯著非特異性結(jié)合的“金標準”SNA、MAL-II兩種凝集素相比,細胞標記實驗驗證了GRABs具有嚴格的唾液酸結(jié)合特異性。將GRAB單體通過生物素/鏈霉親和素系統(tǒng)組裝為四聚體(tetra-GRABs),進一步提高了表觀親和力。利用tetra-GRABs,作者分析了小鼠多種器官組織中的唾液酸化糖質(zhì)分布,并揭示了不同連接方式的唾液酸化糖質(zhì)在小鼠腸道中的分布特征。GRABs和tetra-GRABs在多種糖質(zhì)標記和分析領(lǐng)域,如免疫印跡、流式細胞術(shù)、免疫沉淀和熒光成像中都具有良好的效果,為唾液酸化糖質(zhì)研究提供了一類具有高特異性、高親和力和高便捷性的標記工具。

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北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院陳興教授和戴鵬副研究員為本文的通訊作者,2020級博士研究生梁舒瑜和博士后唐麒為本論文的共同第一作者。郭訓(xùn)孜,李子安郭怡蘭博士,常敬涵,成波博士,宋其濤博士和孫嘉禹等為該工作做出了重要貢獻。該研究獲國家自然科學(xué)基金、北京市自然科學(xué)基金、李革趙寧生命科學(xué)青年研究基金、中國化學(xué)會青年人才托舉工程和“科學(xué)探索獎”等項目的支持。
參考文獻:
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2. Avci, F. Y., Li, X., Tsuji, M. & Kasper, D. L. A mechanism for glycoconjugate vaccine activation of the adaptive immune system and its implications for vaccine design. Nat. Med. 17, 1602–1609 (2011).
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文獻詳情:

Mutant glycosidases for labeling sialoglycans with high specificity and affinity

Shuyu Liang, Qi Tang, Xunzi Guo, Zi’an Li, Yilan Guo, Jinghan Chang, Bo Cheng, Qitao Song, Jiayu Sun, Peng Dai & Xing Chen

Nat Commun. 2025

https://doi.org/10.1038/s41467-025-56629-9

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