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JACS:Pseudo-Aspidosperma生物堿合成中環(huán)加成反應(yīng)的區(qū)域選擇性

來(lái)源:化學(xué)加原創(chuàng)      2022-10-24
導(dǎo)讀:?近日,德國(guó)馬克斯·普朗克化學(xué)生態(tài)學(xué)研究所Lorenzo Caputi和Sarah E. O’Connor團(tuán)隊(duì)在JACS上發(fā)表了題為“Recycling Upstream Redox Enzymes Expands the Regioselectivity of Cycloaddition in Pseudo-Aspidosperma Alkaloid Biosynthesis”的文章,報(bào)道了Dehydrosecodine如何受到氧化還原反應(yīng)的影響,這反過(guò)來(lái)又促使具有替代區(qū)域選擇性的環(huán)加成反應(yīng)發(fā)生。通過(guò)將Dehydrosecodine與在上游途徑中發(fā)揮作用的還原酶和氧化酶一起孵育,作者在體外和從上游中間體植物Nicotiana benthamiana重組獲得罕見(jiàn)的假刺棘植物生物堿pseudo-tabersonine和pseudo-vincadifformine。此外,通過(guò)酶中間體結(jié)構(gòu)表征和氘標(biāo)記監(jiān)測(cè)的方式提出了一種分步機(jī)制來(lái)解釋pseudo-tabersonine骨架的形成。這一發(fā)現(xiàn)揭示了植物如何利用氧化還原酶對(duì)映選擇性地從常見(jiàn)的前體中生成新的骨架。

自然界利用環(huán)加成反應(yīng)生成復(fù)雜的天然產(chǎn)物骨架。Dehydrosecodine是一種高活性的生物合成中間體,經(jīng)過(guò)環(huán)加成可生成幾種生物堿骨架,這些骨架是藥理學(xué)上重要化合物如長(zhǎng)春堿和伊寶加因的前體。一種生產(chǎn)生物堿的夾竹桃科的植物已經(jīng)進(jìn)化出了環(huán)化酶,可以催化一種較高活性的底物—Dehydrosecodine(1)的環(huán)加成反應(yīng),形成獨(dú)特的生物堿骨架。作者和其他團(tuán)隊(duì)最近發(fā)現(xiàn)并表征了已知催化1環(huán)加成反應(yīng)的酶:水甘草堿合成酶(TiTabS和CrTS)[催化(-)-水甘草堿(2)(抗癌藥物長(zhǎng)春堿和長(zhǎng)春新堿的前體)的形成];長(zhǎng)春質(zhì)堿合成酶(CrCS)[催化(+)-長(zhǎng)春質(zhì)堿(3)(長(zhǎng)春花堿和長(zhǎng)春新堿的前體)的形成];和冠狀堿合成酶(TiCorS)[它催化(-)-冠狀定合酶(4)(抗成癮劑伊波加因的前體)的形成]。TiTabS/CrTS和CrCS將1通過(guò)[4+2]環(huán)加成直接生成23,而TiCorS最初形成一種迄今尚未經(jīng)過(guò)表征的不穩(wěn)定中間體,然后被酶還原為4。原則上,底物1可以通過(guò)選擇性環(huán)加成反應(yīng)生成額外的骨架,但這些環(huán)化酶的廣泛突變并沒(méi)有導(dǎo)致酶產(chǎn)物譜的擴(kuò)展。在這里,作者證明了環(huán)化酶TiCorS除了能生成4外,還能產(chǎn)生另一種pseudo-aspidosperma(Ψ-aspidosperma)型生物堿pseudo-tabersonine(Ψ-tabersonine)(5)(Fig. 1)。作者首先通過(guò)表征環(huán)化酶TiCorS產(chǎn)生的不穩(wěn)定中間體來(lái)展示這種轉(zhuǎn)化背后的機(jī)制基礎(chǔ)。這種中間體可以被還原酶捕獲生成4,也可以同時(shí)被還原酶和氧化酶捕獲生成替代骨架5。借助氘標(biāo)記技術(shù)研究了這些酶轉(zhuǎn)化的機(jī)制。簡(jiǎn)而言之,1的化學(xué)反應(yīng)性是由一個(gè)環(huán)化酶和一對(duì)能異構(gòu)烯烴部分的氧化還原酶開(kāi)發(fā)得到,這反過(guò)來(lái)促進(jìn)了新的區(qū)域選擇性環(huán)化反應(yīng)。

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Fig. 1: 夾竹桃科植物產(chǎn)生的dehydrosecodine(1)衍生生物堿(圖片來(lái)源:J. Am. Chem. Soc.

Tabernanthe iboga,一種通過(guò)酶TiTabS和TiCorS分別產(chǎn)生24的植物,也產(chǎn)生Ψ-aspidosperma型生物堿20-epi-ibophyllidine(Fig. 1)。為了確定T. iboga酶可以形成(+)-Ψ-tabersonine 5,作者進(jìn)行了體外偶合生化分析,其中不穩(wěn)定的底物1由上游中間的莖乙酸馬藤堿(6)經(jīng)酶促反應(yīng)生成。6首先被黃酮類precondylocarpine acetate synthase(PAS)氧化生成precondylocarpine acetate(7),然后被中鏈醇脫氫酶dihydroprecondylocarpine acetate合酶(DPAS)進(jìn)行1,4-亞胺還原(Fig. 1)。Dihydroprecondylocarpine acetate(8)經(jīng)過(guò)一個(gè)乙酰氧基的去除生成底物1,然后被一個(gè)環(huán)化酶捕獲(Fig. 1)。

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Fig. 2: Ψ-tabersonine(5)的生物合成(圖片來(lái)源:J. Am. Chem. Soc.

如圖2a所示,作者觀察到在某些條件下,5(而不是4)在使用TiCorS的分析中形成。因此,TiCorS似乎參與了45的生成。作者隨后使用異質(zhì)生產(chǎn)的蛋白質(zhì)進(jìn)行體外試驗(yàn),以探測(cè)導(dǎo)致產(chǎn)物選擇性切換的條件。結(jié)果發(fā)現(xiàn):在pH 7.5時(shí),在TiPAS1?3或CrPAS和TiDPAS1參與下,有利于形成5;在pH 7.5,在TiPAS1?3或CrPAS、TiDPAS1和TiTabS的參與下有利于生成2;而在pH 9.5時(shí),在TiPAS1?3、TiDPAS2和TiCorS參與下有利于生成4Fig. 2a)。之后,作者通過(guò)重建這里報(bào)道的生物合成酶,使其在Nicotiana benthamiana中產(chǎn)生259,進(jìn)一步證實(shí)在體外獲得的結(jié)果(Fig. 2b)。

此外,Dehydrosecodine的酸穩(wěn)定異構(gòu)體,angryline(1a),也可以分離和直接用于環(huán)化分析(Fig. 1)。1a必須在pH值高于8.5的情況下使用,在那里它將開(kāi)環(huán)產(chǎn)生具有反應(yīng)性的1。當(dāng)1a代替6(pH值9.5)用于酶學(xué)測(cè)定時(shí),作者可以觀察到52、49的生成。值得注意的是,PAS(TiPAS1?3,CrPAS)和TiDPAS1對(duì)59的形成都是必需的,這表明Ψ-aspidosperma骨架的形成需要這些酶。然而,在4的生產(chǎn)過(guò)程中不需要PAS。

為了研究TiCorS的作用機(jī)制,作者通過(guò)優(yōu)化初始不穩(wěn)定產(chǎn)物的分離的條件,并使用NaBH4還原捕獲該化合物16-carbomethoxycleavamine(101H NMR表征得到)。這表明TiCorS的初始環(huán)化產(chǎn)物為16-carbomethoxycleaviminium(11)。結(jié)合氘標(biāo)記結(jié)果,當(dāng)TiCorS產(chǎn)物被NaBD4還原時(shí),這將導(dǎo)致11的1,2-還原反應(yīng)的發(fā)生(Fig. 3)。值得注意的是,相關(guān)環(huán)化酶CrCS的晶體結(jié)構(gòu)(70.8%基因序列一致性)顯示,CS最初形成(+)-16-carbomethoxycleaviminium(11a),隨后環(huán)化生成3,但與TiCorS不同的是,中間產(chǎn)物沒(méi)有從活性位點(diǎn)釋放出來(lái)。此外,3在酸性條件下可以開(kāi)環(huán)形成11a。CD光譜顯示TiCorS生成(?)-16-carbomethoxycleavamine(10),這是由CrCS生成的對(duì)映異構(gòu)體。

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Fig. 3: 16-carbomethoxycleavamine(10)的生成(圖片來(lái)源:J. Am. Chem. Soc.

利用對(duì)TiCorS環(huán)化產(chǎn)物的了解,作者提出了4的形成機(jī)制。從TiCorS活性位點(diǎn)釋放后,11被TiDPAS2進(jìn)行1,4-還原,進(jìn)而促進(jìn)第二次環(huán)化形成4Fig. 4)。

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Fig. 4: (?)-iboga 和 (+)-Ψ-aspidosperma生物堿的可能形成機(jī)制(圖片來(lái)源:J. Am. Chem. Soc.

對(duì)于5的形成機(jī)制:TiCorS將1環(huán)化到11,并將其從活性位點(diǎn)釋放,在活性位點(diǎn)上,它被TiDPAS1通過(guò)1,2-還原反應(yīng)還原至10,然后被PAS再氧化。生成的中間產(chǎn)物會(huì)自發(fā)環(huán)化形成59是由PAS氧化雙還原(?)-16-dihydrocarbomethoxycleavamine(12)形成的(Fig. 4)。45之間的轉(zhuǎn)化最終取決于DPAS催化1,4-還原反應(yīng)還是1,2-還原反應(yīng)。實(shí)驗(yàn)pH條件或蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的變化可能是有利于1,2-還原反應(yīng)而不是1,4-還原反應(yīng)的原因。另外,一種尚未發(fā)現(xiàn)的在生理pH下產(chǎn)生4的還原酶可能決定著T. iboga中這種化合物的生物合成。

總結(jié)

Lorenzo Caputi和Sarah E. O’Connor團(tuán)隊(duì)展示了dehydrosecodine(1)如何通過(guò)氧化還原使具有區(qū)域選擇性的環(huán)加成反應(yīng)轉(zhuǎn)化形成(?)-coronaridine(4),(+)-Ψ-tabersonine(5),或(+)-Ψ-vincadifformine(9)。值得注意的是,這些氧化還原酶,DPAS和PAS,將stem madedine acetate(6)轉(zhuǎn)化為dehydrosecodine(1),是從生物合成途徑的上游引入的。因此,這一發(fā)現(xiàn)表明了植物如何在多個(gè)途徑中實(shí)現(xiàn)對(duì)酶的循環(huán)利用。同時(shí),如何控制這些上游酶的招募也是未來(lái)研究的重要方向。


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