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Angew:上大孫強(qiáng)團(tuán)隊(duì)在機(jī)器視覺分析表面超分子結(jié)構(gòu)方面取得進(jìn)展

來源:上海大學(xué)      2022-10-12
導(dǎo)讀:近日,上海大學(xué)材料基因組工程研究院(MGI)孫強(qiáng)教授課題組在機(jī)器視覺分析表面超分子結(jié)構(gòu)方面取得進(jìn)展,研究成果發(fā)表于Angew. Chem. Int. Ed.(最新影響因子: 16.8),論文題目為“A Deep-Learning Framework for the Automated Recognition of Molecules in Scanning-Probe-Microscopy Images”。
計(jì)算機(jī)視覺作為深度學(xué)習(xí)的重要分支,被廣泛運(yùn)用在各類圖像數(shù)據(jù)處理領(lǐng)域。得益于掃描探針顯微鏡(SPM)技術(shù)的發(fā)展,研究人員能夠直觀地在單分子、甚至是單原子尺度上觀察和分析物質(zhì)。然而,一直以來在SPM圖像中提取信息主要依賴于實(shí)驗(yàn)人員的主觀分析。

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圖1:深度學(xué)習(xí)框架工作流程概述。此工作流程從標(biāo)準(zhǔn)SPM圖像采集開始,然后通過t-SNE算法進(jìn)行圖像評估,該算法用于確認(rèn)高分辨率SPM圖像中分子的可分性。隨后,在原始SPM圖像中選擇一個(gè)小區(qū)域的分子進(jìn)行標(biāo)記和數(shù)據(jù)增強(qiáng),并作為實(shí)例分割深度學(xué)習(xí)模型(Mask R-CNN)的數(shù)據(jù)集。最后,機(jī)器視覺模型在訓(xùn)練后將自動(dòng)批量評估SPM圖像并輸出預(yù)測結(jié)果。
在本工作中,作者開發(fā)了一個(gè)深度學(xué)習(xí)框架,運(yùn)用Mask R-CNN目標(biāo)檢測算法來實(shí)現(xiàn)SPM二元或多元納米結(jié)構(gòu)中單分子的識別、分類和實(shí)例分割。為了展現(xiàn)該框架對分子的敏感度,作者使用了在SPM圖像中極為相似的兩種三角形分子作為案例。試驗(yàn)結(jié)果表明,該框架可以高效準(zhǔn)確辨識出兩種分子在SPM圖像上的細(xì)微差別并勾勒出分子輪廓。
另外,課題組與南開大學(xué)王小野教授合作的“Heteroatom-Edged [4]Triangulene: Facile Synthesis and Two-Dimensional On-Surface Self-Assemblies”論文也于近日發(fā)表于Angew. Chem. Int. Ed.。該論文闡述了一種新型的具有氧–硼–氧(OBO)摻雜邊緣的雜[4]三角烯,并實(shí)現(xiàn)了在金屬表面的二維有序組裝(圖2)。實(shí)驗(yàn)和理論計(jì)算表明硼氧雜[4]三角烯能在金屬表面通過分子間C–H···O氫鍵作用,在不同基底的調(diào)控作用下實(shí)現(xiàn)多孔組裝與致密堆積組裝兩種長程有序的結(jié)構(gòu),顯著區(qū)別于無序或孤立存在的全碳[4]三角烯。該工作展示了一類新型硼氧雜[4]三角烯分子,拓展了雜三角烯的材料體系,并進(jìn)一步證明了其形成二維表面自組裝中的潛力,為納米石墨烯分子陣列化及其在未來納電子器件等領(lǐng)域的應(yīng)用提供了新的思路。

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圖2:A.已有的[4]三角烯和本文報(bào)道的硼氧雜[4]三角烯及其在不同基底上的組裝形貌示意圖;B.(a–h)OBO三角烯在不同基底上組裝體的STM圖像;(i)基于不同組裝結(jié)構(gòu)的二聚體模型。

兩篇論文工作主要由上海大學(xué)MGI孫強(qiáng)教授課題組與南開大學(xué)王小野教授課題組合作完成。論文一中孫強(qiáng)教授為唯一通訊作者,第一作者為MGI碩士生朱志文。論文二中孫強(qiáng)教授為共同通訊作者,MGI博士生陸佳宜為共同第一作者。MGI表面科學(xué)課題組(www.qiangsungroup.cn)近年來利用數(shù)據(jù)挖掘、機(jī)器學(xué)習(xí)和人工智能方法,結(jié)合高通量實(shí)驗(yàn)手段研究人工智能在表面科學(xué)中的應(yīng)用,包括機(jī)器視覺、自動(dòng)目標(biāo)識別和性能預(yù)測。
論文一鏈接:https://doi.org/10.1002/anie.202213503
論文二鏈接:https://doi.org/10.1002/anie.202212594
參考資料:https://news.shu.edu.cn/info/1013/65733.htm


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